Szintetikus asztaxantin éstermészetes asztaxantinalapvetően különböznek egymástól; antioxidáns kapacitásuk, tartalmuk és tisztaságuk nem azonos. Felépítésükben különböznek egymástól. Ezért különbségek vannak a hatékonyságában és szerepében.
Kétféleképpen állítják elő: mesterséges szintézissel és biológiai úton. A mesterséges szintézis a karotinból történő előállítás kémiai módszere; A biológiailag természetessé váló anyagnak általában három biológiai forrása van: a vízi termékek feldolgozóiparából származó hulladék, a Phaffia rhodozyma és a mikroalgák (főleg Haematococcus Pluvialis).
Kétféleképpen állítják elő: mesterséges szintézissel és biológiai úton. A szintetikus nemcsak drága, hanem szerkezetét, funkcióját, alkalmazását és biztonságát tekintve is jelentősen eltér a természettől.
A szerkezetet tekintve:
A két végén lévő hidroxilcsoportok (-oh) optikai aktivitása miatt három izomerje van: 3s-3's, 3r-3's, 3r-3'r (is balra forgató, racém, jobbra forgató) Típus, amelyben a szintetikus 3 féle szerkezet (25 százalék balkezes, 25 százalék jobbkezes és kb. 50 százalék racém) keveréke, csekély antioxidáns aktivitással, élesztő eredetű. 100 százalékban jobbra forgató (3r-3'r) és részleges antioxidáns aktivitással rendelkezik; melynek fenti két forrását főként nem ehető állatok és anyagok színezésére használják. Csak algákból származó, 100 százalékban balra forgató (3s-3) szerkezetű, és a legerősebb biológiai aktivitással rendelkezik.
A kémiai szintézis elkerülhetetlenül szennyező vegyi anyagokat, például a szintézis során keletkező nem természetes melléktermékeket vezet be, ami csökkenti a biológiai hozzáférhetőség biztonságát. A természet térnyerésével a kémiailag szintetizált anyagok kezelése világszerte egyre szigorúbbá vált. Például az Egyesült Államok Élelmiszer- és Gyógyszerügyi Hatósága (FDA) megtiltotta a kémiailag szintetizált termékek belépését az élelmiszer- és étrend-kiegészítők (kiegészítők) piacára, a natural pedig általános biztonsági tanúsítványt (GRAS) kapott az FDA-ban. Legálisan bekerülhet az élelmiszerek és étrend-kiegészítők piacára. Termelése általában a természet biológiai forrásainak fejlesztésére irányul, és ezáltal nagy mennyiségben állítja elő.
Az asztaxantin különböző forrásai más kémiai szerkezettel és különböző antioxidáns kapacitással rendelkeznek. Az asztaxantin erős antioxidáns képességét pedig egyedi kialakítása tükrözi. A Haematococcus Pluvialisból kivont asztaxantin 100 százalékban balra forgató szerkezettel rendelkezik, szupererős antioxidáns kapacitással rendelkezik, és biológiai hatékonysága is szuper erős. A phaffia eredetű asztaxantin 100 százalékban jobbkezes szerkezetű. Antioxidáns kapacitása a második; halakból, garnélarákból, rákokból és más állatokból nyerik ki, és három forma keveréke. Az antioxidáns ereje a második, az utolsó pedig a mesterséges szintézis. Az asztaxantin 100 százalékban racém szerkezet, antioxidáns kapacitás nélkül, és nincs olyan biológiai hatékonysága, mint amilyennek az asztaxantinnak kellene, ezért csak kémiai festékként használható.
Ebből adódóan,természetes asztaxantinFelépítésében, élettani funkciójában, alkalmazási hatásában és biztonságában felülmúlja a szintetikus asztaxantint.
